MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-02

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005007	GGT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005007	GAA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005007	CGA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005007	CGA	2	6	329	334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005007	AGG	2	6	423	428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005007	T	6	6	466	471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005007	TTA	2	6	476	481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005007	TA	3	6	505	510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005007	A	6	6	534	539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005007	CAA	2	6	548	553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005007	TAT	2	6	570	575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005007	GT	3	6	576	581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005007	AGGG	2	8	585	592	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005007	A	7	7	606	612	100 %	0 %	0 %	0 %	32470582
15	NC_005007	TAA	2	6	641	646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
16	NC_005007	ATT	2	6	661	666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
17	NC_005007	A	6	6	721	726	100 %	0 %	0 %	0 %	32470582
18	NC_005007	A	7	7	730	736	100 %	0 %	0 %	0 %	32470582
19	NC_005007	A	8	8	744	751	100 %	0 %	0 %	0 %	32470582
20	NC_005007	ATT	2	6	779	784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
21	NC_005007	TAC	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
22	NC_005007	TAC	2	6	817	822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470582
23	NC_005007	TAT	2	6	823	828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470582
24	NC_005007	AAAGC	2	10	835	844	60 %	0 %	20 %	20 %	32470582
25	NC_005007	ATA	2	6	865	870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470582
26	NC_005007	TAT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
27	NC_005007	TTA	2	6	979	984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470583
28	NC_005007	TGG	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470583
29	NC_005007	AT	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	32470583
30	NC_005007	T	7	7	1097	1103	0 %	100 %	0 %	0 %	32470583
31	NC_005007	T	7	7	1139	1145	0 %	100 %	0 %	0 %	32470583
32	NC_005007	GTT	2	6	1167	1172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
33	NC_005007	CTAGA	2	10	1187	1196	40 %	20 %	20 %	20 %	32470583
34	NC_005007	T	6	6	1198	1203	0 %	100 %	0 %	0 %	32470583
35	NC_005007	T	6	6	1242	1247	0 %	100 %	0 %	0 %	32470583
36	NC_005007	TA	3	6	1312	1317	50 %	50 %	0 %	0 %	32470583
37	NC_005007	GTT	2	6	1357	1362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470583
38	NC_005007	T	6	6	1374	1379	0 %	100 %	0 %	0 %	32470583
39	NC_005007	TAAG	2	8	1381	1388	50 %	25 %	25 %	0 %	32470583
40	NC_005007	ATG	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470583
41	NC_005007	ATAA	2	8	1444	1451	75 %	25 %	0 %	0 %	32470583
42	NC_005007	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	32470583
43	NC_005007	AT	3	6	1480	1485	50 %	50 %	0 %	0 %	32470583
44	NC_005007	T	6	6	1510	1515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005007	ATAAAA	2	12	1518	1529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005007	T	6	6	1554	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005007	A	6	6	1584	1589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005007	GTC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_005007	ACATTT	2	12	1708	1719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_005007	GAC	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_005007	T	6	6	1763	1768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005007	AC	3	6	1869	1874	50 %	0 %	0 %	50 %	32470584
53	NC_005007	TTG	2	6	1908	1913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
54	NC_005007	TAA	2	6	1921	1926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
55	NC_005007	AAT	2	6	1928	1933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
56	NC_005007	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
57	NC_005007	AAAAC	2	10	2134	2143	80 %	0 %	0 %	20 %	32470584
58	NC_005007	AGATT	2	10	2177	2186	40 %	40 %	20 %	0 %	32470584
59	NC_005007	TTTTGA	2	12	2191	2202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	32470584
60	NC_005007	GAT	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470584
61	NC_005007	ATT	2	6	2217	2222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
62	NC_005007	TTA	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
63	NC_005007	TAA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470584
64	NC_005007	A	6	6	2336	2341	100 %	0 %	0 %	0 %	32470584
65	NC_005007	GTT	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
66	NC_005007	ATT	2	6	2427	2432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470584
67	NC_005007	AT	3	6	2457	2462	50 %	50 %	0 %	0 %	32470584
68	NC_005007	TGT	2	6	2517	2522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470584
69	NC_005007	GAA	3	9	2531	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470584
70	NC_005007	AATA	2	8	2567	2574	75 %	25 %	0 %	0 %	32470584
71	NC_005007	AATT	2	8	2580	2587	50 %	50 %	0 %	0 %	32470584
72	NC_005007	GATT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	25 %	0 %	32470584
73	NC_005007	TTAA	2	8	2678	2685	50 %	50 %	0 %	0 %	32470584
74	NC_005007	A	6	6	2688	2693	100 %	0 %	0 %	0 %	32470584
75	NC_005007	TAGA	2	8	2724	2731	50 %	25 %	25 %	0 %	32470585
76	NC_005007	A	6	6	2767	2772	100 %	0 %	0 %	0 %	32470585
77	NC_005007	ATG	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470585
78	NC_005007	AG	3	6	2834	2839	50 %	0 %	50 %	0 %	32470585
79	NC_005007	TAGTT	2	10	2869	2878	20 %	60 %	20 %	0 %	32470585
80	NC_005007	ATTA	2	8	2918	2925	50 %	50 %	0 %	0 %	32470585
81	NC_005007	AT	3	6	2937	2942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005007	ACC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_005007	ACG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005007	GAA	2	6	3175	3180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005007	GTG	2	6	3184	3189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005007	CGA	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470586
87	NC_005007	TAAG	2	8	3438	3445	50 %	25 %	25 %	0 %	32470586
88	NC_005007	TAA	2	6	3481	3486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
89	NC_005007	ATA	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470586
90	NC_005007	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470586
91	NC_005007	CAA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470586
92	NC_005007	CAAT	2	8	3605	3612	50 %	25 %	0 %	25 %	32470587
93	NC_005007	AGA	2	6	3630	3635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470587
94	NC_005007	A	6	6	3635	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
95	NC_005007	ATC	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
96	NC_005007	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470587
97	NC_005007	ACGC	2	8	3838	3845	25 %	0 %	25 %	50 %	32470587
98	NC_005007	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
99	NC_005007	A	6	6	3922	3927	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
100	NC_005007	AG	3	6	3931	3936	50 %	0 %	50 %	0 %	32470587
101	NC_005007	A	7	7	3947	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
102	NC_005007	TGA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587
103	NC_005007	CAA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
104	NC_005007	GAG	2	6	4108	4113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470587
105	NC_005007	GA	4	8	4117	4124	50 %	0 %	50 %	0 %	32470587
106	NC_005007	ATCG	2	8	4147	4154	25 %	25 %	25 %	25 %	32470587
107	NC_005007	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	32470587
108	NC_005007	GAAA	2	8	4188	4195	75 %	0 %	25 %	0 %	32470587
109	NC_005007	A	6	6	4198	4203	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
110	NC_005007	GA	3	6	4278	4283	50 %	0 %	50 %	0 %	32470587
111	NC_005007	CAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470587
112	NC_005007	GA	3	6	4314	4319	50 %	0 %	50 %	0 %	32470587
113	NC_005007	A	7	7	4346	4352	100 %	0 %	0 %	0 %	32470587
114	NC_005007	TGA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470587
115	NC_005007	TA	4	8	4425	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005007	GAT	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005007	TTA	2	6	4515	4520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005007	A	6	6	4524	4529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005007	TGA	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005007	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005007	TGA	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005007	ACTT	2	8	4667	4674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.